Molte tra le spiagge di Samotracia sono raggiungibili solo via mare. L'isola è attorniata da spiagge in genere di ciottoli scuri. Di seguito vengono elencate le più conosciute partendo dallo scalo marittimo e immaginando di percorrere l'isola in senso orario.
Paleopolis
Spiaggia sassosa non ideale per la balneazione.
Kipos
Bella spiaggia situata all'estremo sud-est dell'isola.
Vatos
Spiaggia sabbiosa caratterizzata dalla presenza di rocce e caverne e da un mare veramente cristallino. Raggiungibile solo via mare.
Ammos
La più bella spiaggia sabbiosa dell'isola, solitaria e raggiungibile dopo diversi km di sterrato.